Achtung

DIESE DATEN SIND NICHT KDS-KONFORM. DER VALIDATOR WÜRDE SIE ABLEHNEN.

Sie werden aber zum Testen gebraucht, da einige DIZ-FHIR-Server anscheinend mit solchen unvalidierten Daten bespielt wurden.

Allgemein

Es sind 165 neue Patienten mit den gleichen Patientendaten, aus denen der Datensatz POLAR_WP_1.1_v2 generiert wurde, nur dass hier jede Condition eine Referenz zum Encounter hat, aber der Encounter keine Referenz auf die Condition. Die letzte der beiden Referenzen müsste aber auf ...

Allgemein

Es sind 70 neue Patienten mit den gleichen Patientendaten, aus denen der Datensatz POLAR_WP_1.1_v2 generiert wurde. Jeder Patient hat entweder 2 oder 4 Encounter, wobei einer immer ein Einrichtungskontakt ist und ein weiterer Encounter als Part-Of ein Abteilungskontakt. Die beiden zusammengehörigen Encounter haben immer dieselben Start- und Endzeiten. Die zusätzlichen Encounter sind alle mit einer jeweils einer Diagnose verbunden, die im Polar Workpackage 1.1 nicht relevant sind. ...

Allgemein

Datensätze sind aufgeteilt in jeweils 1650 Patienten, die jeweils als json.zip und ndjson verfügbar sind. Die json.zip und ndjson beinhalten jeweils 1000 Transaktion-Bundles mit 1 Patienten. Die gleichnamige Excel-Datei ist die Vorlage zum Generieren JSON-Dateien.

POLAR_WP_1.1_v2

Generierte Daten aus im Grunde nur 165 Patienten (für jede Diagnose 1 Patient), die verhundertfacht wurden. Details siehe unten.

165 verschiedene Patienten (Patient)

• mit jeweils 1 Einrichtungskontakt ...

Image of main FHIR resources with core data set (KDS) compliant linking.

For our R-based workflow on GitHub pulmonologists_interspecies_scRNA, we here provide the processed resulting annotated integrated Seurat file.

References for original datasets :

Human Charité: Hocke A, Hönzke K, Obermayer B, Baumgardt M, Wyler E, Hippenstiel S, Mache C. Charité Berlin /Berlin Institute of Health. GEO accessions GSM5958267, GSM5958272, GSM5958283, GSM5958285

Human Travaglini et al.: published at ...