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| GW_025;GW_025 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_025 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_025;M;53 | 68925394;Yes;30;>60;Primary;Oropharynx;IVB;3;3;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;1003;FALSE;1003;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_026;GW_026 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_026 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_026;M;51 | 53730322;Yes;10;1 to 30;Primary;Oropharynx;III;2;1;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;1058;FALSE;1058;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
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| GW_036;GW_036 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_036 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_036;F;64 | 39698836;Yes;8;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVB;4b;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;793;TRUE;793;TRUE;Atypical IR 1;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_037;GW_037 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_037 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_037;M;56 | 79671458;Yes;60;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;1;2a;0;multi;HPV16;NA;968;TRUE;968;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_038;GW_038 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_038 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_038;M;40 | 26557153;Yes;NA;>60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;947;FALSE;947;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_039;GW_039 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_039 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_039;F;52 | 32580424;No;0;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;1;2b;0;mono;HPV16;NA;933;FALSE;933;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_040;GW_040 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_040 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_040;M;60 | 03011636;Yes;40;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;2;2c;0;multi;HPV16;NA;885;FALSE;221;TRUE;Atypical IR 1;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_041;GW_041 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_041 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_041;F;69 | 75770021;Yes;7;no;Primary;Cavum Oris;IVB;4a;3;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;884;FALSE;884;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_042;GW_042 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_042 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_042;M;50 | 25051335;Yes;111;>60;Primary;Oropharynx;IVB;4b;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;937;FALSE;937;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_043;GW_043 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_043 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_043;M;52 | 32580424;Yes;10;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2b;0;multi;Other HPV;NA;1098;TRUE;118;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_044;GW_044 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_044 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_044;M;71 | 3045859;No;0;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;mono;Other HPV;NA;1002;TRUE;428;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_045;GW_045 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_045 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_045;F;52 | 92265572;Yes;40;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Other HPV;NA;1508;FALSE;1508;FALSE;Mesenchymal 3;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_046;GW_046 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_046 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_046;M;58 | 36276523;Yes;40;>60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;1191;TRUE;1191;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_047;GW_047 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_047 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_047;M;46 | 51882272;Yes;35;no;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;1137;FALSE;1137;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_049;GW_049 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_049 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_049;M;59 | 01984942;Yes;60;31 to 60;Primary;Larynx;IVB;2;3;0;multi;Negative;DNA-;1281;TRUE;1281;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_051;GW_051 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_051 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_051;M;57 | 76043806;Yes;50;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2c;0;mono;Negative;DNA-;753;TRUE;443;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_052;GW_052 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_052 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_052;M;51 | 45790554;Yes;35;>60;Secondary;Hypopharynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;1052;FALSE;463;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_053;GW_053 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_053 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_053;M;47 | 6495551;Yes;12;>60;Primary;Oropharynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;1150;TRUE;322;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_054;GW_054 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_054 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_054;M;48 | 55852156;Yes;35;>60;Primary;Oropharynx;IVA;1;2a;0;multi;Negative;DNA-;1270;TRUE;1270;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_056;GW_056 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_056 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_056;M;68 | 6899384;Yes;45;1 to 30;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;multi;Negative;DNA-;2029;FALSE;2001;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_057;GW_057 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_057 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_057;M;59 | 77549624;Yes;48;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;267;TRUE;267;TRUE;Mesenchymal 3;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_058;GW_058 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_058 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_058;M;51 | 09924709;Yes;30;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;1219;FALSE;1219;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_059;GW_059 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_059 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_059;M;65 | 41820671;Yes;125;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;0;0;mono;Negative;DNA-;1074;FALSE;143;TRUE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_060;GW_060 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_060 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_060;F;78 | 06433949;Yes;50;>60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1179;TRUE;1179;TRUE;Atypical IR 1;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_061;GW_061 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_061 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_061;F;70 | 49418207;No;0;no;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;1066;TRUE;304;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_062;GW_062 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_062 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_062;M;54 | 04517454;Yes;30;>60;Primary;Oropharynx;III;3;1;0;multi;Negative;DNA-;1717;FALSE;1717;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_063;GW_063 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_063 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_063;M;43 | 18959617;Yes;30;>60;Primary;Cavum Oris;III;2;1;0;multi;Negative;DNA-;2059;FALSE;2059;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_064;GW_064 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_064 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_064;M;68 | 22724162;No;0;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2b;0;mono;Negative;DNA-;177;TRUE;177;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_065;GW_065 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_065 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_065;M;69 | 25119781;Yes;40;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;274;TRUE;257;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_066;GW_066 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_066 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_066;M;54 | 00958248;Yes;35;31 to 60;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;1962;TRUE;1711;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_067;GW_067 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_067 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_067;M;56 | 98836413;Yes;41;>60;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;multi;Negative;DNA-;2001;FALSE;2001;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_068;GW_068 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_068 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_068;M;50 | 80903491;Yes;30;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;1597;FALSE;1042;TRUE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_069;GW_069 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_069 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_069;M;49 | 00479124;Yes;30;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;945;FALSE;945;FALSE;Basal 4;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_070;GW_070 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_070 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_070;F;69 | 79876797;No;0;no;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;974;FALSE;974;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_071;GW_071 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_071 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_071;F;59 | 06913073;Yes;33;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;1;2b;0;multi;Negative;DNA-;1002;FALSE;1002;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_072;GW_072 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_072 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_072;F;50 | 64476386;Yes;15;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;1016;FALSE;1016;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_073;GW_073 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_073 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_073;M;52 | 82956879;Yes;36;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2a;0;multi;Negative;DNA-;1004;FALSE;1004;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_074;GW_074 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_074 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_074;M;87 | 40862423;No;0;no;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2b;0;palliative;Negative;DNA-;1002;TRUE;1002;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_075;GW_075 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_075 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_075;M;56 | 78850103;Yes;40;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;982;FALSE;982;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_076;GW_076 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_076 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_076;M;56 | 76933607;Yes;40;>60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;961;FALSE;507;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_077;GW_077 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_077 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_077;M;64 | 5338809;Yes;75;31 to 60;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;954;FALSE;954;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_078;GW_078 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_078 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_078;F;52 | 56947296;Yes;30;no;Primary;Cavum Oris;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;951;TRUE;503;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_079;GW_079 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_079 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_079;M;56 | 862423;Yes;40;>60;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;944;FALSE;517;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_080;GW_080 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_080 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_080;M;67 | 32922656;Yes;30;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;1;0;multi;Negative;DNA-;941;FALSE;941;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_081;GW_081 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_081 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_081;M;48 | 17522245;Yes;35;>60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;906;TRUE;394;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_082;GW_082 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_082 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_082;M;54 | 13278576;Yes;30;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;927;FALSE;864;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_083;GW_083 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_083 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_083;M;61 | 34702259;No;0;>60;Primary;Oropharynx;IVB;1;3;0;multi;Negative;DNA-;896;FALSE;285;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_084;GW_084 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_084 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_084;M;40 | 04654346;Yes;17;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;903;TRUE;279;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_085;GW_085 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_085 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_085;M;58 | 92676249;Yes;31;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;875;FALSE;875;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_086;GW_086 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_086 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_086;M;77 | 11704312;Yes;45;31 to 60;Primary;Larynx;IVA;4a;2c;0;mono;Negative;DNA-;906;FALSE;906;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_087;GW_087 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_087 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_087;M;68 | 31759069;Yes;48;no;Primary;Hypopharynx;III;3;1;0;multi;Negative;DNA-;1808;TRUE;468;TRUE;Mesenchymal 3;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_088;GW_088 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_088 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_088;M;58 | 01779603;Yes;15;no;Primary;Oropharynx;IVA;2;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;1837;FALSE;1837;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_089;GW_089 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_089 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_089;M;55 | 70704997;Yes;30;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2c;0;multi;NA;NA;304;TRUE;287;TRUE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_091;GW_091 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_091 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_091;M;63 | 50992471;Yes;76;>60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;652;TRUE;346;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_092;GW_092 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_092 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_092;M;61 | 2238193;Yes;40;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;2033;TRUE;228;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_093;GW_093 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_093 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_093;M;57 | 14715948;Yes;60;>60;Primary;Oropharynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;1827;FALSE;1827;FALSE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_094;GW_094 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_094 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_094;M;51 | 19233402;Yes;30;>60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2c;0;mono;Other HPV;NA;1872;TRUE;136;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_095;GW_095 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_095 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_095;F;70 | 0971937;No;0;no;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA+;2025;FALSE;2025;FALSE;Atypical IR 1;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_096;GW_096 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_096 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_096;F;55 | 6440794;Yes;10;1 to 30;Primary;Oropharynx;III;2;1;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;1855;FALSE;1855;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_097;GW_097 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_097 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_097;F;56 | 39698836;Yes;28;>60;Primary;Oropharynx;III;3;1;0;multi;Negative;DNA-;2310;FALSE;2310;FALSE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_101;GW_101 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_101 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_101;M;69 | 09514031;No;0;no;Secondary;Larynx;II;2;0;0;multi;Negative;DNA-;499;TRUE;499;TRUE;Classical 2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_102;GW_102 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_102 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_102;M;40 | 39425051;Yes;7;>60;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;679;TRUE;569;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_103;GW_103 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_103 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_103;M;77 | 40999316;No;0;31 to 60;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1099;FALSE;166;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_104;GW_104 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_104 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_104;M;71 | 66872005;Yes;45;31 to 60;Primary;Hypopharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1219;FALSE;1219;FALSE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_105;GW_105 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_105 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_105;M;52 | 42710472;Yes;30;>60;Primary;Larynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;1904;FALSE;1904;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_106;GW_106 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_106 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_106;M;49 | 25667351;Yes;45;>60;Primary;Hypopharynx;IVC;4a;2c;1;multi;Negative;DNA-;23;TRUE;23;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_107;GW_107 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_107 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_107;M;44 | 45995893;Yes;30;31 to 60;Primary;Oropharynx;I;1;0;0;multi;Negative;DNA-;1176;FALSE;846;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;1;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_108;GW_108 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_108 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_108;M;72 | 66803559;Yes;25;1 to 30;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1147;FALSE;1147;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_109;GW_109 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_109 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_109;F;70 | 40930869;No;0;1 to 30;Primary;Cavum Oris;III;1;1;0;multi;Negative;DNA-;1178;FALSE;1178;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_110;GW_110 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_110 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_110;M;63 | 20054757;No;0;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;1;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;1123;FALSE;1123;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_111;GW_111 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_111 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_111;M;67 | 44969199;Yes;50;31 to 60;Primary;Larynx;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;1051;FALSE;1051;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_112;GW_112 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_112 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_112;M;74 | 03969884;Yes;30;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;1;0;multi;Negative;DNA-;1184;FALSE;1184;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_113;GW_113 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_113 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_113;M;60 | 03285421;Yes;16;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;1192;FALSE;1192;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_115;GW_115 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_115 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_115;M;56 | 91444216;Yes;25;>60;Primary;Larynx;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;1808;FALSE;1808;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_116;GW_116 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_116 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_116;M;69 | 29500342;Yes;30;>60;Primary;Larynx;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;1332;FALSE;1332;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_117;GW_117 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_117 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_117;M;69 | 724846;Yes;50;1 to 30;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1305;FALSE;1305;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_118;GW_118 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_118 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_118;M;57 | 908282;Yes;40;1 to 30;Primary;Hypopharynx;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;1024;FALSE;1024;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_119;GW_119 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_119 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_119;M;54 | 16016427;Yes;15;>60;Primary;Hypopharynx;III;3;1;0;multi;Negative;DNA-;1060;FALSE;1060;FALSE;Atypical IR 1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_120;GW_120 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_120 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_120;F;68 | 32032854;No;0;1 to 30;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;1;0;multi;Negative;DNA-;602;TRUE;602;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_122;GW_122 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_122 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_122;M;77 | 28405202;Yes;80;31 to 60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;multi;Negative;DNA-;831;TRUE;484;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_123;GW_123 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_123 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_123;M;50 | 29431896;Yes;30;1 to 30;Primary;Hypopharynx;III;2;1;0;multi;Negative;DNA-;1067;FALSE;1067;FALSE;Basal 4;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_124;GW_124 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_124 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_124;M;80 | 27104723;Yes;65;31 to 60;Primary;Larynx;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;118;TRUE;118;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_125;GW_125 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_125 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_125;F;56 | 56673511;No;0;no;Primary;Larynx;IVA;3;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;1107;FALSE;1107;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_126;GW_126 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_126 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_126;M;52 | 3340178;Yes;45;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;954;FALSE;954;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_127;GW_127 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_127 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_127;M;68 | 10951403;Yes;20;1 to 30;Primary;Cavum Oris;III;1;1;0;multi;Negative;DNA-;834;FALSE;834;FALSE;Basal 4;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_128;GW_128 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_128 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_128;M;55 | 34839151;Yes;40;>60;Primary;Larynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;253;TRUE;253;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_129;GW_129 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_129 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_129;F;58 | 19575633;Yes;30;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;4a;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;1252;FALSE;1252;FALSE;Basal 4;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_130;GW_130 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_130 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_130;M;74 | 81177276;No;0;1 to 30;Primary;Larynx;IVC;4a;1;1;multi;Negative;DNA-;521;TRUE;457;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_131;GW_131 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_131 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_131;M;51 | 28268309;Yes;35;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;968;FALSE;968;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_133;GW_133 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_133 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_133;M;55 | 12388775;Yes;39;31 to 60;Primary;Larynx;IVB;3;3;0;multi;Negative;DNA-;429;TRUE;429;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_134;GW_134 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_134 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_134;M;70 | 68309377;Yes;20;1 to 30;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1211;FALSE;1211;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_135;GW_135 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_135 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_135;M;60 | 06844627;Yes;45;>60;Primary;Larynx;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;1182;FALSE;67;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_136;GW_136 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_136 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_136;M;81 | 76591376;No;0;1 to 30;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;582;TRUE;561;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_137;GW_137 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_137 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_137;M;52 | 40520192;Yes;30;>60;Primary;Hypopharynx;III;2;1;0;multi;Negative;DNA-;996;FALSE;996;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_138;GW_138 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_138 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_138;M;61 | 97672827;Yes;60;>60;Primary;Hypopharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;979;FALSE;979;FALSE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_139;GW_139 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_139 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_139;M;56 | 29568789;Yes;70;>60;Primary;Larynx;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;1043;FALSE;1043;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_140;GW_140 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_140 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_140;M;58 | 6146475;Yes;NA;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;1270;TRUE;674;TRUE;Atypical IR 1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_141;GW_141 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_141 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_141;M;67 | 06365503;No;0;1 to 30;Primary;Larynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;885;FALSE;885;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_142;GW_142 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_142 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_142;M;57 | 13347023;Yes;60;>60;Primary;Larynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;1185;FALSE;1185;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_143;GW_143 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_143 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_143;M;58 | 93497604;Yes;60;>60;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;811;TRUE;811;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_144;GW_144 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_144 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_144;M;65 | 64544832;Yes;45;31 to 60;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1024;FALSE;1024;FALSE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_145;GW_145 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_145 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_145;M;44 | 72279261;Yes;50;>60;Primary;Larynx;IVA;3;2b;0;mono;Negative;DNA-;856;FALSE;733;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_146;GW_146 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_146 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_146;M;51 | 6495551;Yes;33;>60;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;1017;FALSE;1017;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_147;GW_147 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_147 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_147;F;72 | 52019165;No;0;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;3;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;489;TRUE;489;TRUE;Atypical IR 1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_148;GW_148 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_148 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_148;M;64 | 41615332;Yes;50;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;1057;FALSE;468;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_149;GW_149 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_149 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_149;M;55 | 95345654;Yes;40;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2c;0;mono;Other HPV;NA;1057;TRUE;188;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_150;GW_150 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_150 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_150;M;70 | 71321013;Yes;55;>60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;multi;Negative;DNA-;1009;TRUE;1009;TRUE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_151;GW_151 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_151 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_151;M;53 | 89459274;Yes;40;>60;Primary;Cavum Oris;III;3;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA-;1107;FALSE;1008;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_152;GW_152 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_152 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_152;M;48 | 82683094;Yes;45;>60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA+;875;FALSE;875;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_153;GW_153 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_153 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_153;M;42 | 78986995;No;0;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;689;TRUE;622;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_154;GW_154 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_154 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_154;M;56 | 96372348;No;0;>60;Primary;Cavum Oris;IVC;4a;2a;1;mono;Negative;DNA-;275;TRUE;275;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_155;GW_155 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_155 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_155;M;44 | 62696783;Yes;25;>60;Primary;Hypopharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;631;TRUE;531;TRUE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_156;GW_156 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_156 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_156;M;66 | 45311431;Yes;10;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;1365;FALSE;1365;FALSE;Basal 4;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_157;GW_157 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_157 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_157;M;56 | 94729637;Yes;40;31 to 60;Primary;Hypopharynx;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;815;FALSE;815;FALSE;Atypical IR 1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_158;GW_158 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_158 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_158;M;68 | 33127995;Yes;50;31 to 60;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;793;FALSE;793;FALSE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_159;GW_159 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_159 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_159;M;77 | 69199179;No;0;31 to 60;Primary;Hypopharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;356;TRUE;356;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_160;GW_160 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_160 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_160;M;64 | 50924025;Yes;60;no;Primary;Larynx;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;794;FALSE;794;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_163;GW_163 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_163 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_163;F;44 | 30663929;Yes;10;1 to 30;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;multi;Negative;DNA-;793;FALSE;309;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_164;GW_164 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_164 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_164;M;70 | 98151951;Yes;48;31 to 60;Primary;Larynx;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;272;TRUE;272;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_165;GW_165 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_165 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_165;M;55 | 85489391;Yes;30;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;1025;FALSE;1025;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_166;GW_166 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_166 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_166;M;52 | 62149213;Yes;35;>60;Primary;Oropharynx;III;1;1;0;mono;HPV16;DNA+RNA-;734;FALSE;434;TRUE;Atypical IR 1;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_167;GW_167 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_167 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_167;M;72 | 11225188;Yes;15;1 to 30;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;846;FALSE;846;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_168;GW_168 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_168 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_168;M;83 | 4825462;No;0;no;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;713;FALSE;713;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_169;GW_169 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_169 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_169;M;77 | 045859;Yes;60;1 to 30;Primary;Hypopharynx;III;2;1;0;mono;Negative;DNA-;1245;FALSE;1245;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_170;GW_170 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_170 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_170;M;54 | 39561944;Yes;35;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;4a;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA+;725;TRUE;426;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_171;GW_171 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_171 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_171;F;52 | 68172485;Yes;3;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;755;FALSE;755;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_172;GW_172 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_172 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_172;M;45 | 76043806;Yes;33;31 to 60;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;758;FALSE;196;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_173;GW_173 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_173 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_173;M;72 | 74195756;Yes;45;31 to 60;Primary;Larynx;III;3;0;0;multi;Negative;DNA-;417;TRUE;353;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_174;GW_174 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_174 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_174;F;50 | 2642026;No;0;no;Primary;NA;III;3;1;0;multi;Negative;DNA-;1291;FALSE;1291;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_175;GW_175 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_175 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_175;M;73 | 03216975;Yes;20;1 to 30;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;1;0;mono;Negative;DNA-;269;TRUE;269;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_177;GW_177 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_177 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_177;M;61 | 64544832;Yes;40;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;730;FALSE;730;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_178;GW_178 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_178 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_178;M;62 | 75975359;Yes;55;31 to 60;Primary;Hypopharynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;882;FALSE;882;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_179;GW_179 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_179 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_179;M;59 | 17043121;Yes;25;1 to 30;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;764;FALSE;764;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_180;GW_180 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_180 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_180;M;56 | 57494867;Yes;50;>60;Primary;Oropharynx;IVA;2;2a;0;multi;Negative;DNA-;1059;FALSE;700;TRUE;Basal 4;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_181;GW_181 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_181 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_181;M;61 | 85352498;Yes;112 | 5;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;743;FALSE;743;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | |||||||
| GW_182;GW_182 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_182 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_182;M;57 | 07597536;Yes;41;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;257;TRUE;257;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_183;GW_183 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_183 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_183;M;77 | 79876797;Yes;20;>60;Primary;Larynx;I;1;0;0;mono;Negative;DNA-;617;TRUE;609;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_184;GW_184 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_184 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_184;M;55 | 75906913;Yes;25;>60;Primary;Larynx;IVA;2;2b;0;multi;Negative;DNA-;120;TRUE;120;TRUE;Mesenchymal 3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_185;GW_185 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_185 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_185;M;57 | 67830253;Yes;50;31 to 60;Primary;Larynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;1162;FALSE;1162;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_186;GW_186 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_186 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_186;M;69 | 79876797;Yes;38;31 to 60;Primary;Larynx;IVA;4a;0;0;mono;Negative;DNA-;758;FALSE;758;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_187;GW_187 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_187 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_187;M;45 | 34976044;No;0;31 to 60;Primary;Cavum Oris;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;765;FALSE;765;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_188;GW_188 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_188 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_188;M;50 | 16016427;Yes;35;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;3;2c;0;mono;Negative;DNA-;146;TRUE;146;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_189;GW_189 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_189 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_189;M;59 | 62765229;Yes;40;31 to 60;Primary;Hypopharynx;IVB;4a;3;0;multi;Negative;DNA-;209;TRUE;209;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_190;GW_190 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_190 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_190;M;74 | 69678303;No;0;>60;Primary;Larynx;IVA;3;2b;0;multi;Negative;DNA-;769;FALSE;769;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_191;GW_191 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_191 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_191;M;52 | 12867899;Yes;42;>60;Primary;Larynx;I;1;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA-;785;FALSE;785;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_192;GW_192 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_192 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_192;M;42 | 67761807;Yes;35;>60;Primary;Hypopharynx;III;2;1;0;multi;Negative;DNA-;843;FALSE;843;FALSE;Classical 2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_193;GW_193 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_193 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_193;M;76 | 55030801;Yes;50;1 to 30;Primary;Larynx;IVA;4a;0;0;multi;Negative;DNA-;826;FALSE;826;FALSE;Basal 4;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_196;GW_196 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_196 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_196;M;57 | 45927447;Yes;45;>60;Primary;Hypopharynx;IVB;2;3;0;multi;Negative;DNA-;258;TRUE;258;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_197;GW_197 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_197 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_197;M;48 | 29568789;Yes;20;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;0;0;mono;Negative;DNA-;139;TRUE;115;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_198;GW_198 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_198 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_198;M;46 | 92676249;Yes;15;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;710;FALSE;710;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_199;GW_199 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_199 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_199;M;50 | 66392882;Yes;35;31 to 60;Primary;Hypopharynx;IVA;4a;2b;0;multi;Negative;DNA-;769;FALSE;769;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_200;GW_200 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_200 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_200;F;70 | 99794661;Yes;9;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVC;2;2c;1;multi;Negative;DNA-;305;TRUE;92;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_201;GW_201 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_201 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_201;M;52 | 05201916;Yes;35;>60;Primary;Oropharynx;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;871;FALSE;871;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_202;GW_202 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_202 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_202;M;76 | 3504449;Yes;50;31 to 60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;mono;Negative;DNA-;466;TRUE;283;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_203;GW_203 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_203 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_203;M;61 | 10609172;Yes;90;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;1;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA-;855;FALSE;855;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Non-disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_204;GW_204 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_204 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_204;M;47 | 15947981;No;0;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;1;0;multi;Negative;DNA-;857;FALSE;857;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_205;GW_205 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_205 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_205;M;58 | 28336756;No;0;no;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;840;FALSE;840;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_206;GW_206 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_206 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_206;M;53 | 65366188;Yes;60;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVA;4a;2c;0;multi;Negative;DNA-;147;TRUE;147;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_207;GW_207 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_207 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_207;M;51 | 88501027;Yes;15;1 to 30;Primary;Cavum Oris;IVB;4b;3;0;mono;Negative;DNA-;182;TRUE;124;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_209;GW_209 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_209 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_209;M;48 | 89801506;Yes;30;>60;Primary;Cavum Oris;IVA;3;2c;0;multi;Negative;DNA-;825;FALSE;825;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_210;GW_210 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_210 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_210;M;56 | 3613963;Yes;20;>60;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;790;FALSE;601;TRUE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;Disruptive;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_211;GW_211 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_211 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_211;F;53 | 91101985;Yes;10;1 to 30;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;877;FALSE;539;TRUE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_212;GW_212 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_212 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_212;M;75 | 70978782;Yes;120;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;2;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;813;FALSE;568;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_214;GW_214 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_214 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_214;M;58 | 68035592;Yes;60;>60;Primary;Oropharynx;IVA;3;2c;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;268;TRUE;239;TRUE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_215;GW_215 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_215 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_215;M;48 | 81587953;Yes;24;31 to 60;Primary;Oropharynx;IVA;2;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;785;FALSE;785;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_216;GW_216 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_216 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_216;M;56 | 3394935;Yes;13;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;2;2c;0;mono;Other HPV;NA;777;FALSE;777;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_217;GW_217 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_217 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_217;M;62 | 14099932;No;0;1 to 30;Primary;Oropharynx;IVA;3;2b;0;multi;HPV16;DNA+RNA+;778;FALSE;778;FALSE;Atypical IR 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_218;GW_218 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_218 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_218;F;75 | 38398357;No;0;1 to 30;Primary;Cavum Oris;I;1;0;0;mono;HPV16;DNA+RNA-;787;FALSE;787;FALSE;Mesenchymal 3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 | ||||||||
| GW_219;GW_219 Head and neck squamous cell carcinoma Illumina HT12v4;GW_219 Head and neck squamous cell carcinoma;Homo sapiens;;GW_219;M;48 | 29842574;Yes;20;no;Primary;Oropharynx;II;2;0;0;mono;Negative;DNA-;750;FALSE;750;FALSE;Basal 4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;WT;0;total RNA;biotin;;GPL10558 |
